約200Å（オングストローム：１×10^-10m）の間隙を介して神経細胞間を連結している部位。信号が神経細胞末端へ到着すると，このシナプス間隙に特殊な化学伝達物質が分泌される。これをシナプスを挟んで反対側にある神経細胞が受容し，神経信号を発生して信号を伝達する。記憶や学習によってシナプスでの信号の伝達が変化するといわれている。